حمید باکری در همان دوران کوتاه شروع جنگ ایران و عراق تا شهادت، فرماندهی ایستگاه خط 7 آبادان، جانشین فرمانده لشکر 31 عاشورا، فرمانده گردان تیپ نجف اشرف در عملیات بیت المقدس را در دوران جنگ تحمیلی برعهده داشت.